樓主，你的波怎么出來的，你沒有設置這兩路的占空比吧
我用了你的代碼，并在while中加了兩句       
TIM_SetCompare3(TIM3,270);
TIM_SetCompare4(TIM3,270);
用示波器看過了兩路都有波。
要不你再while中也加上這兩句，如果PC9還沒波，而且你還沒有在別的地方用過這個引腳，那就是你的這個引腳壞了

復用并不是外設引腳隨便配置，而指的是一個引腳有多個外設公用，但是任何一個時刻只能有一個外設使用它。你是不是還有別的地方用到了

查一下手冊，看看PWM允許從哪些端口輸出。